Ass. Prof. Dr. Nihat Mustafayev begann seine berufliche Laufbahn mit der Erlangung seines medizinischen Doktortitels nach einer sechsjährigen disziplinierten Ausbildung an der medizinischen Fakultät der Turgut Ozal-Universität. Nach Abschluss seiner neurologischen Spezialisierung an der Bezmialem-Universität Istanbul führte er Studien zur Neuromodulation und ultraschallgesteuerten Botulinumtoxin-Anwendungen durch.
Er absolvierte ein Stipendium am Department of Algology der UCLA University in den USA, arbeitete bei der Austrian American Association, hielt international Vorträge und war Herausgeber des Buches „Practical Approaches to Medical Aesthetics“. Außerdem vertiefte er sein Wissen durch seine Arbeit an der Ambulanz für Bewegungsstörungen am AKH-Krankenhaus in Wien, Österreich.
Er ist außerdem Mitglied renommierter Organisationen, die seinen Ruf in seinem Fachgebiet untermauern. Er ist aktives Mitglied wichtiger Verbände wie der International Headache Society und des European Committee for Treatment and Research in Multiple Sclerosis (ECTRIMS). Er ist außerdem Mitglied renommierter Organisationen wie der Turkish Neurological Association, der European Academy of Neurology und der International Headache Society.